Я думаю, вы должны указать Schema в ваших bean-компонентах, она должна работать, как показано ниже -
@Table(name = "some_table", schema = "some_schema")
Если вы используете Hibernate.cfg.xml, вы можетеукажите, как,
...
<property name="hibernate.default_schema" value="myschema"/>
...'
ИЛИ, если вы используете собственные запросы SQL
select c1, c2 from schema1.table1