Использование psycopg2 для копирования в таблицу со столбцом ARRAY INT - PullRequest
0 голосов
/ 27 ноября 2018

Я создал таблицу со структурой, похожей на следующую:

create table some_table (
        id serial,
        numbers int []
);

Я хочу эффективно скопировать фрейм данных pandas, поэтому я не хочу использовать медленный to_sql методИтак, после https://stackoverflow.com/a/41876462/754176 и https://stackoverflow.com/a/29125940/754176 я попробовал следующее:

import pandas as pd
import psycopg2

# Create the connection, and the cursor (ommited)

# Function from the second link
def lst2pgarr(alist):
    return '{' + ','.join(alist) + '}'


df = pd.DataFrame({'numbers': [[1,2,3], [4,5,6], [7,8,9]]})

df['numbers'] = df.numbers.apply(lambda x: lst2pgarr([str(y) for y in x]))

import io
f = io.StringIO()
df.to_csv(f, index=False, header=False, sep="|")
f.seek(0)

cursor.copy_from(f, 'some_table', columns=["numbers"], sep='|')

cursor.close()

Этот код не выдает ошибку, но ничего не записывает в таблицу.

Итак, я изменил код на

import csv

df = pd.DataFrame({'numbers': [[1,2,3], [4,5,6], [7,8,9]]})

df['numbers'] = df.numbers.apply(lambda x: lst2pgarr([str(y) for y in x]))


f = io.StringIO()
df.to_csv(f, index=False, header=False, sep="|", quoting=csv.QUOTE_ALL, quotechar="'"))
f.seek(0)

cursor.copy_from(f, 'some_table', columns=["numbers"], sep='|')

cursor.close()

Этот код выдает следующую ошибку:

---------------------------------------------------------------------------
DataError                                 Traceback (most recent call last)
<ipython-input-40-3c58c4a64abc> in <module>
----> 1 cursor.copy_from(f, 'some_table', columns=["numbers"], sep='|')

DataError: malformed array literal: "'{1,2,3}'"
DETAIL:  Array value must start with "{" or dimension information.
CONTEXT:  COPY some_table, line 1, column numbers: "'{1,2,3}'"

Что мне делать?

Также будет интересно узнать, почему первый код не выдает ошибку.

1 Ответ

0 голосов
/ 01 декабря 2018

Этот код не выдает ошибку, но ничего не записывает в таблицу.

Код работает хорошо, если вы совершаете транзакцию:

cursor.close()
connection.commit()
...