Исправьте меня, если я ошибаюсь, но я верю, что вы можете добавить -D fdb к аргументам сборки hxml, а затем в FlashDevelop, я думаю, вы сможете использовать точки останова и тому подобное.
Никогда не пробовал сам, хотя я не запускаю FlashDevelop на моем Mac.