Для получения сертификатов из хранилища локальных компьютеров вы можете использовать FindAllAsync (CertificateQuery) .Передайте имя магазина через запрос сертификата следующим образом:
var query = new CertificateQuery();
query.StoreName = "ROOT";
return CertificateStores.FindAllAsync(query)
FindAllAsync () получает сертификаты только из магазина приложения.Если приложение имеет функцию shareusercertificates, этот вызов также будет получать сертификаты из хранилища пользователей.