Не через свойства, но вы можете просто переопределить автоматическую конфигурацию загрузки по умолчанию для фабрики ...
@Bean
public ConcurrentKafkaListenerContainerFactory<?, ?> kafkaListenerContainerFactory(
ConcurrentKafkaListenerContainerFactoryConfigurer configurer,
ConsumerFactory<Object, Object> kafkaConsumerFactory) {
ConcurrentKafkaListenerContainerFactory<Object, Object> factory = new ConcurrentKafkaListenerContainerFactory<>();
configurer.configure(factory, kafkaConsumerFactory);
factory.setBatchListener(true);
return factory;
}