используйте strace
в Linux, он покажет вам все системные вызовы, сделанные любой программой (включая python).В Windows вы должны использовать что-то вроде wt или, может быть, Logger.exe , который отслеживает все вызовы библиотеки (не только системные).
Вы можете использовать отладчик, например gdb
для просмотра машинного кода в реальном времени, и, поскольку у вас есть исходный код CPython, лучшей альтернативой будет просто скомпилировать его с символами отладки, а затем запустить его в отладчике C, что может дать вам стек вызовов высокого уровня, которыйбудет намного легче понять.