SyntaxError: неожиданный EOF при разборе с .format и циклом for

Question

Я пытаюсь сделать этот цикл, но я получаю эту ошибку, любой совет?

for file in glob.glob("results/dir_bam/*_dedup.bam"):
  f_name = file_name(file)
  cmd = 'java -jar {} GenomeAnalysisTK ' \
        '-T IndelRealigner ' \
        '-R {} '\
        '-I {} ' \
        '-targetIntervals {} ' \
        '-known 1000G_phase1. InDels .hg19. VCF ' \
        '-known Mills_and_1000G_gold_standard. InDels .hg19. VCF '\
        '-o aligned_reads.sorted.dedup.realigned. BAM' \
        .format(picard, path_ref_gen, file,
                'results/dir_bam/' + f_name + '.intervals', 
                'results/dir_bam/' + f_name + '_realigned.bam')

SyntaxError: неожиданный EOF при синтаксическом анализе

Я пытался сразные вкладки и пробелы, но я не работал.Проблема исходит от .format части.