Я получаю ошибку при выполнении функции clustal () в r - PullRequest
0 голосов
/ 27 ноября 2018

Я новичок R и пытаюсь запустить команду clustal(sylvia.seq)

Я получаю следующую ошибку:

sh: clustalw2: command not found
Error in clustal(sylvia.seq) : 
   cannot find executable ‘clustalw2’ on your computer.
  It is recommended that you place the executable of Clustal
  in a directory on the PATH of your computer which is:
/bin
/Library/TeX/texbin
/opt/X11/bin
/sbin
/usr/bin
/usr/local/bin
/usr/sbin
In addition: Warning message:
In system(paste(exec, opts), ignore.stdout = quiet) :
  error in running command

В другом посте я видел, как это исправить для Windows,но, к сожалению, я использую macos и не могу заставить его работать.

1 Ответ

0 голосов
/ 27 ноября 2018

У меня не было разрешений на добавление файла в какую-либо папку, но / opt / X11 / bin .

Поэтому я добавил туда и теперь он работает, но я пытался сотдохнуть и не смог этого сделать.

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...