в случае, если таблица A всегда имеет большее значение, чем таблица B
SELECT A.ID , (A.PRICE - B.PRICE) AS PRICE FROM A JOIN B ON A.ID = B.ID
, если A не всегда имеет большее значение, чем B, вы можете использовать функцию ABS
SELECT A.ID , ABS(A.PRICE - B.PRICE) AS PRICE FROM A JOIN B ON A.ID = B.ID