R-код для GEE занимает слишком много времени или не будет работать - PullRequest
0 голосов
/ 04 февраля 2019

Я пытаюсь запустить многомерную порядковую модель GEE с использованием R. Поскольку я работаю с порядковыми данными (по порядку 1, 2, 3), я рассмотрел два пакета, которые нужно использовать: 1) 'ordgee' из geepack и 2)'ordLORgee' от Multgee.Мой результат также коррелирован, поэтому я использую ссылку logit.

Мой набор данных включает более 40 000 продольных наблюдений.Мой код из Multgee и Geepack работает, если я работаю с меньшим набором данных (например, 500, 1000), но когда я пытаюсь запустить эти функции с использованием полного набора данных, требуется более 3 часов, чтобы получить сообщение об ошибке, что мое соединение Rпотерян.

из мультгэ я пытаюсь уместить:

ordLORgee(output ~ day + pre2 + pre3 + pre4, id = person, link = 'logit', data = sampledf)

из геэпак я пытаюсь уложить:

ordgee(ordered(output) ~ day + pre2 + pre3 + pre4, id = person, data = final)

Может кто-нибудь подскажите пожалуйста гдеэта проблема исходит?В идеале я хочу использовать пакет multgee, поскольку этот метод package / GEE является относительно новым, и я не мог получить большую помощь в Интернете.Спасибо.

...