Ядро дампов может быть из-за несоответствия между Tensorflow Hdf5 1.10.1 и Hdf 1.10.2, установленным с conda - PullRequest
0 голосов
/ 26 сентября 2018

Я думаю, что есть некоторая проблема с моей установкой TensorFlow, когда я попытался импортировать ее, я получил вывод, который я скопировал ниже.

Теперь я думаю, что это связано с разницей между версией TensorFlow HDF5 (1.10.1) и установка conda HDF5, т. Е. 1.10.2, может быть, потому что я установил TensorFlow GPU по маршруту pip.Что, вы парни, думаете?Я прав и что мне делать, чтобы решить эту проблему?

Внимание! Ошибка несоответствия версии библиотеки HDF5 Заголовочные файлы HDF5, использованные для компиляции этого приложения, не соответствуют версии, используемой библиотекой HDF5, с которой связано это приложение.Повреждение данных или ошибки сегментации могут возникнуть, если приложение продолжит работу.Это может произойти, когда приложение было скомпилировано одной версией HDF5, но связано с другой версией статической или общей библиотеки HDF5.Вам следует перекомпилировать приложение или проверить параметры, относящиеся к вашей общей библиотеке, такие как «LD_LIBRARY_PATH».Вы можете на свой страх и риск отключить это предупреждение, установив для переменной среды «HDF5_DISABLE_VERSION_CHECK» значение «1».Установка его на 2 или выше полностью подавит предупреждающие сообщения.Заголовки 1.10.1, библиотека 1.10.2 РЕЗЮМЕ КОНФИГУРАЦИИ HDF5 ================================ *

Общая информация:

               HDF5 Version: 1.10.2
              Configured on: Wed May  9 23:24:59 UTC 2018
              Configured by: root@19a5a2e5-30a4-45db-5607-0c407004981e
                Host system: x86_64-conda_cos6-linux-gnu
          Uname information: Linux 19a5a2e5-30a4-45db-5607-0c407004981e 4.4.0-62-generic #83-Ubuntu SMP

Ср. 18 января 14:10:15 UTC 2017 x86_64 x86_64 x86_64 GNU / Linux Байт пол: little-endian Точка установки: / home / anukoolpurohit / anaconda3

Параметры компиляции:

                 Build Mode: production
          Debugging Symbols: no
                    Asserts: no
                  Profiling: no
         Optimization Level: high

Параметры связывания:

                  Libraries: static, shared   Statically Linked Executables: 
                    LDFLAGS: -Wl,-O2 -Wl,--sort-common -Wl,--as-needed -Wl,-z,relro -Wl,-z,now -Wl,-rpath,/home/anukoolpurohit/anaconda3/lib -L/home/anukoolpurohit/anaconda3/lib
                 H5_LDFLAGS: 
                 AM_LDFLAGS:  -L/home/anukoolpurohit/anaconda3/lib
            Extra libraries: -lrt -lpthread -lz -ldl -lm 
                   Archiver: /tmp/build/80754af9/hdf5_1525908201964/_build_env/bin/x86_64-conda_cos6-linux-gnu-ar
                   AR_FLAGS: cr
                     Ranlib: /tmp/build/80754af9/hdf5_1525908201964/_build_env/bin/x86_64-conda_cos6-linux-gnu-ranlib

Языки:

                          C: yes
                 C Compiler: /tmp/build/80754af9/hdf5_1525908201964/_build_env/bin/x86_64-conda_cos6-linux-gnu-cc
                   CPPFLAGS: -DNDEBUG -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O2
                H5_CPPFLAGS: -D_GNU_SOURCE -D_POSIX_C_SOURCE=200112L   -DNDEBUG -UH5_DEBUG_API
                AM_CPPFLAGS:  -I/home/anukoolpurohit/anaconda3/include
                    C Flags: -march=nocona -mtune=haswell -ftree-vectorize -fPIC -fstack-protector-strong -fno-plt -O2 -pipe -I/home/anukoolpurohit/anaconda3/include -fdebug-prefix-map=${SRC_DIR}=/usr/local/src/conda/${PKG_NAME}-${PKG_VERSION} -fdebug-prefix-map=${PREFIX}=/usr/local/src/conda-prefix
                 H5 C Flags:   -std=c99 -pedantic -Wall -Wextra -Wbad-function-cast -Wc++-compat -Wcast-align -Wcast-qual -Wconversion -Wdeclaration-after-statement -Wdisabled-optimization -Wfloat-equal -Wformat=2 -Winit-self -Winvalid-pch -Wmissing-declarations -Wmissing-include-dirs -Wmissing-prototypes -Wnested-externs -Wold-style-definition -Wpacked -Wpointer-arith -Wredundant-decls -Wshadow -Wstrict-prototypes -Wswitch-default -Wswitch-enum -Wundef -Wunused-macros -Wunsafe-loop-optimizations -Wwrite-strings -finline-functions -s -Wno-inline -Wno-aggregate-return -Wno-missing-format-attribute -Wno-missing-noreturn -O
                 AM C Flags: 
           Shared C Library: yes
           Static C Library: yes


                    Fortran: yes
           Fortran Compiler: /tmp/build/80754af9/hdf5_1525908201964/_build_env/bin/x86_64-conda_cos6-linux-gnu-gfortran
              Fortran Flags: 
           H5 Fortran Flags:  -pedantic -Wall -Wextra -Wunderflow -Wimplicit-interface -Wsurprising -Wno-c-binding-type  -s -O2
           AM Fortran Flags: 
     Shared Fortran Library: yes
     Static Fortran Library: yes

                        C++: yes
               C++ Compiler: /tmp/build/80754af9/hdf5_1525908201964/_build_env/bin/x86_64-conda_cos6-linux-gnu-c++
                  C++ Flags: -fvisibility-inlines-hidden -std=c++17 -fmessage-length=0 -march=nocona -mtune=haswell -ftree-vectorize -fPIC -fstack-protector-strong -fno-plt -O2 -pipe -I/home/anukoolpurohit/anaconda3/include -fdebug-prefix-map=${SRC_DIR}=/usr/local/src/conda/${PKG_NAME}-${PKG_VERSION} -fdebug-prefix-map=${PREFIX}=/usr/local/src/conda-prefix
               H5 C++ Flags:   -pedantic -Wall -W -Wundef -Wshadow -Wpointer-arith -Wcast-qual -Wcast-align -Wwrite-strings -Wconversion -Wredundant-decls -Winline -Wsign-promo -Woverloaded-virtual -Wold-style-cast -Weffc++ -Wreorder -Wnon-virtual-dtor -Wctor-dtor-privacy -Wabi -finline-functions -s -O
               AM C++ Flags: 
         Shared C++ Library: yes
         Static C++ Library: yes

                       Java: no

Функции:

              Parallel HDF5: no
         High-level library: yes
               Threadsafety: yes
        Default API mapping: v110  With deprecated public symbols: yes
     I/O filters (external): deflate(zlib)
                        MPE: no
                 Direct VFD: no
                    dmalloc: no  Packages w/ extra debug output: none
                API tracing: no
       Using memory checker: yes Memory allocation sanity checks: no
        Metadata trace file: no
     Function stack tracing: no
  Strict file format checks: no    Optimization instrumentation: no Bye... Aborted (core dumped)
...