Таким образом, я сделал , и все закончилось тем, что катал свой собственный, это было довольно просто благодаря PyGTK, запросам + json.
Результат на Github: https://github.com/floe/github-bulk-editor, обратная связь приветствуется!
(Несмотря на то, что он допускает только массовую передачу репозиториев, потому что это то, что мне сейчас нужно, я старался сделать внутренние компоненты настолько универсальными, насколько это возможно, поэтому большинство других команд API Github должно быть очень легко добавить.)