Я бы попытался добавить путь к SQLite в PATH.
Дополнительно: SQLite 3 не "установлен". Это DLL, обычно незарегистрированная. Большая часть программного обеспечения, использующего SQLite 3, будет полагаться на локальную копию или копию, указанную в переменной среды.