Используйте фильтры обрезки, vstack, масштаба и форматирования:
ffmpeg -i input.mkv -filter_complex "[0:v]crop=560:24:0:0[top];[0:v]crop=560:384:1076:128[bottom];[top][bottom]vstack,scale=280:-2[out]" -map "[out]" -c:v libx264 -preset veryfast -crf 30 -movflags +faststart result.mp4
Если вы хотите несколько усложнить это для более быстрой фильтрации (возможно), тогда вы можете сначала попробовать масштабировать:
ffmpeg -i input.mkv -filter_complex "[0:v]scale=iw/2:-1,split[v0][v1];[v0]crop=560/2:24/2:0:0[top];[v1]crop=560/2:384/2:1076/2:128/2[bottom];[top][bottom]vstack[out]" -map "[out]" -c:v libx264 -preset veryfast -crf 30 -movflags +faststart result.mp4
Вам придется поэкспериментировать, чтобы увидеть, какой из них самый быстрый для вас.