Кажется, ты был довольно близко.Вам необходимо передать HashMap , содержащий необходимые конфигурации, экземпляру класса ChromeOptions следующим образом:
System.setProperty("webdriver.chrome.driver", "C:/chromedriver/chromedriver.exe");
HashMap<String, Object> chromePrefs = new HashMap<String, Object>();
chromePrefs.put("profile.default_content_settings.popups", 0);
chromePrefs.put("safebrowsing.enabled", "true"); //this is the needed configuration
ChromeOptions options = new ChromeOptions();
options.setExperimentalOption("prefs", chromePrefs);
WebDriver driver = new ChromeDriver(options);