Скопируйте файлы в новую папку в r, используя фрейм справочных данных - PullRequest
0 голосов
/ 29 ноября 2018

Я пытаюсь использовать R grep определенных файлов из папки и выводить их в другую папку, используя контрольный фрейм данных, чтобы сопоставить файлы со связанными метаданными, чтобы я мог обработать их в другой программе.Однако я не уверен, как заставить R использовать опорный фрейм данных для grep и перемещения файлов.

У меня есть большое количество файлов спектра, которые нужно просмотреть, которые находятся в папках по дате выборки (я не могу объединитьэти папки), и у них есть повторяющиеся имена файлов (т.е. в каждой папке есть файлы с одинаковыми именами). Мне нужно отсортировать их по обработке, а также по дате, не просматривая каждую папку и не извлекая их вручную.

У меня есть отдельный файл, который включает метаданные, относящиеся к каждому отдельному файлу спектра.Я создал фрейм данных, включающий в себя только ту информацию, которая мне нужна для сортировки файлов спектра.

'data.frame': 102 obs. of 6 variables: $ Treatment : chr "1A60" "1A35" "1A27" "1A27" ... $ Date : Date, format: "2018-08-29" "2018-08-29" "2018-08-29" ... $ Chamber_ID : chr NA NA NA NA ... $ GasmetID : chr "G2" "G2" "G2" "G2" ... $ Spectrum.file: chr "Spectrum_000012.spe" "Spectrum_000019.spe" ... $ Time : Time: "10:32" "10:34" "10:36" "10:38" ...

Я знаю, как копировать и перемещать файлы в другую папку, но не знаюзнаете, как сортировать и искать их, используя этот фрейм данных.

Мысли?

...