За исключением файла App.config, который должен находиться в папке приложения, вы можете поместить их в любое место. Однако я бы порекомендовал установить логически организованную структуру папок в папке приложения для всех необходимых файлов приложения, и папка « config » для всех файлов конфигурации, безусловно, является хорошим началом. на это.
Просто помните, что если файл конфигурации , а не в папке приложения, вы должны поместить строку перенаправления в app.config, чтобы сообщить подсистеме конфигурации, где ее искать ...
<appSettings configSource="Config\AppSettings.config" />