Мне пришлось перестроить пример данных, чтобы ответить на вопрос, как я его понял, скажите, работает ли он для вас:
set.seed(2)
df <- data.frame(subject=sample(1:3,9,T),
T = sample(c(0,1),9,T),
O = sample(c(0,1),9,T),
E = sample(c(0,1),9,T),
P = sample(c(0,1),9,T),
score=round(rnorm(9,10,3)))
# subject T O E P score
# 1 1 1 0 0 1 12
# 2 3 1 0 1 0 9
# 3 2 0 1 0 1 13
# 4 1 1 0 0 0 3
# 5 3 0 1 0 1 14
# 6 3 0 0 1 0 13
# 7 1 1 0 1 0 17
# 8 3 1 0 1 0 12
# 9 2 0 0 1 1 14
cols1 <- c("T","O","E","P")
df$comb <- apply(df[cols1],1,function(x) paste(names(df[cols1])[as.logical(x)],collapse=""))
# subject T O E P score comb
# 1 1 1 0 0 1 12 TP
# 2 3 1 0 1 0 9 TE
# 3 2 0 1 0 1 13 OP
# 4 1 1 0 0 0 3 T
# 5 3 0 1 0 1 14 OP
# 6 3 0 0 1 0 13 E
# 7 1 1 0 1 0 17 TE
# 8 3 1 0 1 0 12 TE
# 9 2 0 0 1 1 14 EP
library(tidyverse)
df %>%
group_by(subject,comb) %>%
summarize(score=mean(score)) %>%
spread(comb,score) %>%
ungroup
# # A tibble: 3 x 7
# subject E EP OP T TE TP
# * <int> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
# 1 1 NA NA NA 3 17.0 12
# 2 2 NA 14 13 NA NA NA
# 3 3 13 NA 14 NA 10.5 NA
Второй шаг в базе R:
means <- aggregate(score ~ subject + comb,df,mean)
means2 <- reshape(means,timevar="comb",idvar="subject",direction="wide")
setNames(means2,c("subject",sort(unique(df$comb))))
# subject E EP OP T TE TP
# 1 3 13 NA 14 NA 10.5 NA
# 2 2 NA 14 13 NA NA NA
# 5 1 NA NA NA 3 17.0 12