Функция распараллеливания с использованием внешних указателей (XPtr) - PullRequest
Новая
       38

Функция распараллеливания с использованием внешних указателей (XPtr)

0 голосов
/ 05 февраля 2019

Этот вопрос не является ни дубликатом этого , ни этого , который касался функций, возвращающих внешние указатели.

Вот проблема.Далее в коде Rcpp определены две функции, одна из которых создает XPtr, а другая может работать на XPtr. 

#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;

//[[Rcpp::export]]
SEXP f(int n) {
  std::vector<int> * v = new std::vector<int>;

  for(int i = 0; i < n; i++)
    v->push_back(i);

  XPtr< std::vector<int> > p(v, true);
  return p;
}

//[[Rcpp::export]]
int g(XPtr< std::vector<int> > p, int i) {
  return (*p)[i];

И все работает нормально: 

> x <- f(100)
> g(x, 45)
[1] 45

Давайте попробуемраспараллелить звонки на g.Это работает: 

require(parallel)
test1 <- function(a) {
  cl <- makeForkCluster(nnodes=2)
  r <- parLapply(cl, 1:5, function(i) g(a,i) )
  stopCluster(cl)
  return(r)
}

Ожидаемое поведение: 

> unlist( test1(x) )
[1] 1 2 3 4 5

Но это не работает: 

test2 <- function(a) {
  cl <- makeForkCluster(nnodes=2)

  p <- g(a, 0)
  r <- parLapply(cl, 1:5, function(i) g(a,i) )
  stopCluster(cl)
  return(r)
}

Неожиданное поведение: 

> test2(x)
Error in checkForRemoteErrors(val) : 
  2 nodes produced errors; first error: external pointer is not valid

Кажется, проблема возникает из-за того, что внешний указатель используется в функции один раз перед вызовом ведомых в кластере.Чем объясняется такое поведение, и есть ли обходной путь?Большое спасибо заранее.

1 Ответ

0 голосов
/ 05 февраля 2019

В начале вашей функции, a - это обещание, то есть то, что говорит об оценке определенного выражения в определенной среде.Когда вы обращаетесь к переменной, выражение вычисляется, поэтому теперь a является указателем, и этот указатель является специфическим для конкретного экземпляра R.Вы можете посмотреть на это, используя pryr::promise_info: 

test2 <- function(a) {
  cl <- makeForkCluster(nnodes = 2)
  print(pryr::promise_info(a))
  p <- g(a, 0)
  print(pryr::promise_info(a))
  stopCluster(cl)
  return(r)
}

Вывод: 

$code
x

$env
<environment: R_GlobalEnv>

$evaled
[1] FALSE

$value
NULL

$code
x

$env
NULL

$evaled
[1] TRUE

$value
<pointer: 0x565295e3a410>

Одним из способов является использование eval(substitute(a)): 

test2 <- function(a) {
  cl <- makeForkCluster(nnodes = 2)
  print(pryr::promise_info(a))
  p <- g(eval(substitute(a)), 0)
  print(pryr::promise_info(a))
  r <- parLapply(cl, 1:5, function(i) g(a,i) )
  stopCluster(cl)
  return(r)
}

IЯ уверен, что есть лучшие способы.Нестандартные оценки все еще немного чужды мне ...

...