Варианты выдачи с использованием heatmap2 в R - PullRequest
0 голосов
/ 06 февраля 2019

Я создаю тепловую карту с информацией дендрограммы.Моя проблема заключается в правильности параметров тепловой карты, как вы можете видеть на следующем рисунке, разделители белого цвета не все видны, они присутствуют только слева на рисунке.Вот настройки, которые я использовал:

graphe<-heatmap.2(result,  
          margins=c(7,10),
          sepcolor="white",
          sepwidth=c(0.01,0.01),
          Rowv = dend1,
          Colv = F,
          dendrogram="row",
          colsep=seq(1,10,1),
          rowsep=seq(1,134,1),
          key = TRUE,
          trace="none",
          col=color,
          lhei = c(1,50),
          cexCol = 0.7,
          cexRow = 0.7,
          density.info=c("none"),
          scale = "none",
          na.color = "yellow"
)

Я думаю, проблема в colsep and rowsep, но я не совсем понимаю, как работают эти опции.Может ли кто-нибудь помочь мне понять?

1 Ответ

0 голосов
/ 06 февраля 2019

После документов: colsep, rowsep, sepcolor (необязательно) вектор целых чисел, указывающий, какие столбцы или строки должны быть отделены от предыдущих столбцов или строк узким пространством цветового сепариста.

В ваших настройках у вас есть colsep = seq (1,10,1) , который, кажется, разделяет только первые 10 столбцов.

...