Если вы просто хотите переместить ваши данные и схему из одной в другую, это не должно быть слишком сложно, хотя, если вы используете один из темных углов mySQL, вещи могут стать более опасными. По сути, вы должны вывести свою базу данных mySql в какой-то файл (существует множество способов сделать это, например, из командной строки или из чего-то вроде phpmyAdmin), а затем, если память будет работать (это было давно, так как я в последний раз сделал это), сделайте что-то вроде этого:
sqlite3 <database name> ".import <export file name>"
Кроме того, есть скрипт для автоматизации этого на этой странице веб-сайта sqlite, так что вы можете увидеть, работает ли он на самом деле.