Попробуйте установить autorange = TRUE
для обеих осей x и y в опции layout
.
Это решило проблему для меня.
Пример:
plot_ly(x, y, type = "bar") %>%
layout(xaxis = list(autorange = TRUE),
yaxis = list(autorange = TRUE))
Для других модификаций координатных осей в R проверьте эту страницу .