Я успешно (как нет проблем с установкой и работой по умолчанию) несколько раз выполнял следующее:
Перенос основного приложения, построенного на LAMP (ubuntu и других), на WAMP (сервер 2008).
Управлял одновременно SQL Server и MySQL 5 с одного и того же сервера 2008 года.
MySQL 5 и SQL Server были запущены одновременно на моем портативном компьютере более года (оба в качестве служб без остановок).
Обновлены все чехлы с 5.0 до 5.1.
Настроил запросы и конфигурацию базы данных на ноутбуке и реализовал результаты на сервере с соответствующими преимуществами.
Я был бы очень удивлен, если бы вы увидели сбой, связанный с операционной системой.