Возможность указать местоположение значка с помощью <link> - это новая функция.
Первоначальный подход (который используется здесь) состоит в том, чтобы просто поместить файл по URL /favicon.ico ипусть браузер запросит его (и поэтому файлы журнала были заполнены 404 ошибками).