Как экспортировать среду conda, включая пакеты, установленные в терминале R? - PullRequest
Новая
       14

Как экспортировать среду conda, включая пакеты, установленные в терминале R?

0 голосов
/ 29 сентября 2018

У меня есть несколько пакетов R, которые не будут работать при установке с conda, поэтому я должен установить их непосредственно в R.

Вот как я экспортировал свою среду: 

conda env export --name python3 --file ./py3_env.yml

Вот моя экспортируемая среда: 

https://pastebin.com/XWdeYZc4

Установленные мной пакеты, такие как WGCNA и edgeR, которые являются критическими для моей среды, не отображаются.

(python3) Joshs-MacBook-Pro:~ mu$ ls ~/anaconda/envs/python3/lib/R/library/WGCNA/
CITATION    INDEX       NAMESPACE   data        html
DESCRIPTION Meta        R       help        libs

Я хочу экспортировать свою среду, чтобы другие могли установить ее на разные машины.Как я могу это сделать, а также перехватить пакеты, установленные через R?

...