Я могу ошибаться, но я не думаю, что это то, чего вы можете достичь, не обработав сначала ваши данные, зацикливаясь на всех ребрах, в которые входит B, создавая массив соседей B, а затем создавая новые ребра, связывающие их.
Точный способ сделать это зависит от формата ваших данных и языка программирования.
Вы также можете добавить ребра вручную в Gephi, но это, конечно, реалистично только для небольших графиков.
Я не думаю, что фильтры являются правильным инструментом для этого, потому что они просто исключают узлы (и ребра), но не создают новые.https://github.com/gephi/gephi/wiki/Filter