Насколько я могу судить, Xamarin Shell еще не на 100% готов к настройке / расширению для фреймворков 3-х частей, таких как Prism.
Например, отсутствует один обработчик для навигации по оболочке, которая потребуется для условных обозначений модели представления и внедрения зависимостей.