MonoDevelop поставляется с пользовательской версией Gtk2 + Xwt в комплекте.Если вы планируете использовать Gtk3, то дизайнер должен быть деактивирован, поскольку он не будет работать с Gtk3.
В любом случае, мой совет, независимо от того, какой инструментарий вы используете, - избегать использования дизайнера.Как только вы задействуете конструктор, ваш код в значительной степени зависит от используемой вами IDE (Visual Studio, MonoDevelop, NetBeans ... вы называете его).
Создание пользовательских интерфейсов «вручную» больше не травмирует, так какэто было в 90-х годах с Windows API.Например, вы можете найти очень хороший учебник Gtk # в ZetCode .
Инструменты интерфейса пользователя на самом деле очень похожи, они меняют имя виджетов и иногда предоставляют немного другой макет, новсе они в основном одинаковы, независимо от того, являются ли они WinForms или Gtk (для C #), Swing (Java) или Qt (C ++ и другие).