Аннотации в основном основаны на файлах конфигурации, которые включают / отключают их распознавание.
Используйте пружинные профили для различения классов конфигурации.Если появится специальный профиль, классы конфигурации не будут распознаны.Решение требует, чтобы все конфигурации конфигурировались в соответствии с профилями Spring.
@Configuration
@Profile("noAnnotations")
public class SomeConfigurationClass