Вы можете сначала выполнить запрос SELECT, а затем вставить или сделать это за одну поездку, как показано ниже (SQL Server).Вы можете использовать одно из рекомендуемых расширений Dapper из списка здесь
string cmd = @"IF NOT EXISTS (SELECT * FROM Table1 WHERE SupplierId=@SupplierId AND InvoiceId=@InvoiceId)
BEGIN
INSERT INTO Table1(SupplierId, InvoiceId) VALUES(@SupplierId, @InvoiceId)
END";
using (var dbConn = new SqlConnection("Server=(local);Database=MyDatabase;Integrated Security=true"))
{
dbConn.Execute(cmd, new { SupplierId = 1, InvoiceId = 2 });
}
Console.ReadKey();
ОБНОВЛЕНИЕ Для MySQL вы можете написать что-то вроде
INSERT INTO Table1 (SupplierId, InvoiceId) VALUES(@SupplierId, @InvoiceId) ON DUPLICATE KEY SupplierId=SupplierId
https://dev.mysql.com/doc/refman/5.7/en/insert-on-duplicate.html