Сначала найдите общее количество строк для печати, затем зациклите это много раз.Печатать пробелы (слева) или ничего (справа), если текущая строка превышает размер списка.
private static void printDrinks(List<int[]> storageRoom, List<int[]> saleRoom){
int rows = Math.max(storageRoom.size(), saleRoom.size());
System.out.println("EAN STOCK CAPACITY | EAN STOCK CAPACITY");
for (int i = 0; i < rows; i++) {
if (i < storageRoom.size())
System.out.printf("%3d %7d %10d |", storageRoom.get(i)[0], storageRoom.get(i)[1], storageRoom.get(i)[2]);
else
System.out.printf("%25s", "|");
if (i < saleRoom.size())
System.out.printf(" %3d %7d %10d", saleRoom.get(i)[0], saleRoom.get(i)[1], saleRoom.get(i)[2]);
System.out.println();
}
}
Тесты
printDrinks(Arrays.asList(new int[][] {{10,3,3},{11,1,6},{12,5,7},{13,7,9},{14,4,7},{15,0,7},{16,0,2}}),
Arrays.asList(new int[][] {{10,2,4},{11,4,5},{12,6,9},{13,3,5},{14,0,4}}));
printDrinks(Arrays.asList(new int[][] {{10,2,4},{11,4,5},{12,6,9},{13,3,5},{14,0,4}}),
Arrays.asList(new int[][] {{10,3,3},{11,1,6},{12,5,7},{13,7,9},{14,4,7},{15,0,7},{16,0,2}}));
Выходы
EAN STOCK CAPACITY | EAN STOCK CAPACITY
10 3 3 | 10 2 4
11 1 6 | 11 4 5
12 5 7 | 12 6 9
13 7 9 | 13 3 5
14 4 7 | 14 0 4
15 0 7 |
16 0 2 |
EAN STOCK CAPACITY | EAN STOCK CAPACITY
10 2 4 | 10 3 3
11 4 5 | 11 1 6
12 6 9 | 12 5 7
13 3 5 | 13 7 9
14 0 4 | 14 4 7
| 15 0 7
| 16 0 2