Вам нужно правильно сослаться на файл.
Один из методов - поместить все CSS-файлы в папку css
, что бы html выглядело так:
<link rel="stylesheet" type="text/css" href="mystyle.css/">
Другой способ - сослаться на css в корневой папке, как будто вы, вероятно, настроили его, что будет выглядеть так:
<link rel="stylesheet" type="text/css" href="./css/mystyle.css/">