Вот пример кода использования, который я создал после проб и ошибок.Этот фильтр создает все строки, число которых превышает 1000. Соответственно могут использоваться и другие фильтры.
var dataSheet = SpreadsheetApp.getActiveSpreadsheet().getSheetByName("Data");
var newCriteria = SpreadsheetApp.newFilterCriteria()
.whenNumberGreaterThan(1000)
.build();
dataSheet.getFilter().setColumnFilterCriteria(5, newCriteria);