Вы пробовали использовать IN
DELETE FROM users WHERE id IN (3,4,5,9)
Хотя в своих приложениях я никогда ничего не удаляю. Вместо этого у меня есть активный флаг, который я установил в ложь.
UPDATE users set active=0 where id in (3,4,5,9)
У всех запросов затем есть предложение where для active=1
, а 1 - это значение по умолчанию для активного флага в таблице.