Вы можете использовать any
вместе с numpy
индексированием для выбора столбцов с ненулевыми значениями.
Настройка
a = np.array([[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0],
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0],
[0, 0, 2, 3, 4, 5, 6, 0, 0],
[0, 1, 4, 5, 6, 7, 8, 0, 0],
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]], dtype=int64)
a[:, a.any(0)]
array([[0, 0, 0, 0, 0, 0],
[0, 0, 0, 0, 0, 0],
[0, 2, 3, 4, 5, 6],
[1, 4, 5, 6, 7, 8],
[0, 0, 0, 0, 0, 0]], dtype=int64)