Возможно, вы не хотите иметь один экземпляр Zend Framework для всего вашего сервера, поскольку возможно, что разные приложения захотят использовать разные версии. Хотя в вашем случае это, вероятно, не имеет большого значения. :)
Что касается начала работы с Zend, на сайте Zend есть отличное руководство по , которое вы можете прочитать.