Сначала определите файл appender:
log4j.appender.LOGFILE=org.apache.log4j.FileAppender
log4j.appender.LOGFILE.File=/mylogfile.log
log4j.appender.LOGFILE.Append=true
log4j.appender.LOGFILE.layout=org.apache.log4j.PatternLayout
log4j.appender.LOGFILE.layout.ConversionPattern=%d [%t] %-5p %c %x - %m%n
Затем укажите ваш пакет, чтобы использовать этот appender:
log4j.logger.mypackage=LOGFILE
log4j.additivity.mypackage=false
Последняя строка важна, если вы не хотите, чтобы ваш пакет наследовал глобальный appender. Это приведет к тому, что сообщения журнала из mypackage также будут напечатаны в приложении по умолчанию.