Для этого вы можете использовать функцию автоматического разделения perl:
perl -lane 'push @F, join("", splice(@F,3)); print join " ", @F'
Пример:
% echo 'abc def ghi jkl mno pqr' | perl -lane 'push @F, join("", splice(@F,3)); print join " ", @F'
abc def ghi jklmnopqr