Я исправил проблему, был класс ResizeBilinear.Я использую это, прежде чем я templateMatch, и он работает.
ResizeBilinear resizeBilinear = new ResizeBilinear(200, 200);
bitmapConverted = resizeBilinear.Apply(bitmapConverted);
bitMapTemplate = resizeBilinear.Apply(bitMapTemplate);
//comparing our to bmp
TemplateMatch[] templateMatcheArray = exhaustiveTemplateMatching.ProcessImage(bitmapConverted, bitMapTemplate);