Подсчитайте количество вхождений букв в строку Python - PullRequest
0 голосов
/ 15 ноября 2009

Итак, я получил последовательность ДНК.

ACCAGAGCGGCACAGCAGCGACATCAGCACTAGCACTAGCATCAGCATCAGCATCAGC
CTACATCATCACAGCAGCATCAGCATCGACATCAGCATCAGCATCAGCATCGACGACT
ACACCCCCCCCGGTGTGTGTGGGGGGTTAAAAATGATGAGTGATGAGTGAGTTGTGTG
CTACATCATCACAGCAGCATCAGCATCGACATCAGCATCAGCATCAGCATCGACGACT
TTCTATCATCATTCGGCGGGGGGATATATTATAGCGCGCGATTATTGCGCAGTCTACG
TCATCGACTACGATCAGCATCAGCATCAGCATCAGCATCGACTAGCATCAGCTACGAC

Мне нужно посчитать базы.

Также по некоторым причинам он может иногда чередоваться между прописными или строчными буквами в одной строке.

1 Ответ

7 голосов
/ 15 ноября 2009
for base in 'ACGT':
  print base, thesequence.count(base) + thesequence.count(base.lower())
Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...