То, что вы ищете, на самом деле не является частью scriptaculous, но является частью прототипа. Код, который вы ищете, будет одним из следующих:
$('element').relativize(); // to make the element relatively positioned
$('element').absolutize(); // to make the element absolutely positioned
$('element').setStyle({position:'fixed'}); // to make the element fixed