Простая функция для форматирования корреляционной матрицы rcorr.adjust (RcmdrMisc) - PullRequest
0 голосов
/ 11 февраля 2019

вот результат rcorr.adjust корреляции Пирсона:

    Eucgr.A00001.v2.0 Eucgr.A00003.v2.0 Eucgr.A00004.v2.0
Eucgr.A00001.v2.0            1.0000            0.1926            0.7389
Eucgr.A00003.v2.0            0.1926            1.0000           -0.0559
Eucgr.A00004.v2.0            0.7389           -0.0559            1.0000

 Number of observations: 12 

 Pairwise two-sided p-values:
                  Eucgr.A00001.v2.0 Eucgr.A00003.v2.0 Eucgr.A00004.v2.0
Eucgr.A00001.v2.0                   0.5487            0.0060           
Eucgr.A00003.v2.0 0.5487                              0.8631           
Eucgr.A00004.v2.0 0.0060            0.8631                             

 Adjusted p-values (Holm's method)
                  Eucgr.A00001.v2.0 Eucgr.A00003.v2.0 Eucgr.A00004.v2.0
Eucgr.A00001.v2.0                   1.0000            0.0181           
Eucgr.A00003.v2.0 1.0000                              1.0000           
Eucgr.A00004.v2.0 0.0181            1.0000

как я могу преобразовать его в таблицу, содержащую строки и имена столбцов и P и настроить P?

примерно так:

row               column             cor   P-value  padj    
Eucgr.A00001.v2.0 Eucgr.A00003.v2.0 0.1926 0.5487 1.0000  
Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...