Это создаст довольно медленное приложение. Я бы настоятельно рекомендовал бы использовать серверы БД и приложений в одной сети.
Но если вы действительно не можете, просто защитите его, как и любой публичный сервер:
- Блокировка до IP-адресов
- Убедитесь, что пароль безопасен
- Потенциально изменить порт по умолчанию на что-то нестандартное