Вы можете сделать это так, перечислив свои индексы:
def search(term):
s = Search(index=['index1', 'index2']).filter('match_phrase', title=term)
response = s.execute()
return response
или так, используя подстановочный знак
def search(term):
s = Search(index='index*').filter('match_phrase', title=term)
response = s.execute()
return response