Будет ли это crm onpremise или онлайн, удаление systemuser невозможно (по крайней мере, поддерживаемым способом) и не рекомендуется делать неподдерживаемым способом (например, SQL Delete в onpremise).
Вы можете удалить все роли и команды безопасности, в которые он / она входит (позаботьтесь обо всех WF, принадлежащих им записях)
Только вы можете отключить это, выполнив предварительную или отозвавлицензия на портале O365 для репликации в crmol
Если учетная запись AD удалена / отключена, она должна реплицироваться в Dynamics
Нет способа сделать вВ любом случае, в разных организациях
Редактировать:
На основе комментариев можно разработать консольное приложение C # для итерации по нескольким строкам подключения CRM и вызова вызова службы sdk для целизапись системного пользователя в каждом экземпляре.