К сожалению, 100% точек в ваших данных с полом = 1 имеют yv = NA.Ваши данные на самом деле содержат только данные пола = 0.
summary(covar[covar$sex==1,])
yv sex
Min. : NA Min. :1
1st Qu.: NA 1st Qu.:1
Median : NA Median :1
Mean :NaN Mean :1
3rd Qu.: NA 3rd Qu.:1
Max. : NA Max. :1
NA's :187533
table(covar$sex)
0 1
220685 187533
sum(is.na(covar[covar$sex ==1,1]))
[1] 187533