Как построить Ho v Hs в dartR? - PullRequest
       10

Как построить Ho v Hs в dartR?

0 голосов
/ 06 декабря 2018

У меня есть набор данных SNP от Dartseq (148 человек и 12 123 локуса).Я анализирую это в dartR.Я рассчитал Ho (gl.Ho (gl)) и Hs (gl.Hs (gl)) в dartR.Я хочу построить сюжет Ho v Hs.Как мне это сделать, пожалуйста?Я думаю, что это должно быть так просто, но я не добился прогресса.Я знаю следующее:

head(Ho)

39086092-43-A/T 39030115-36-G/T 39036131-46-C/T 39031387-28-T/A  39043148-8-C/T 
0.006944444     0.000000000     0.014184397     0.076388889     0.007246377 
 39052543-5-C/T 
0.000000000 

str(Ho) # # Shows the structure of the data

Named num [1:12119] 0.00694 0 0.01418 0.07639 0.00725 ...
 - attr(*, "names")= chr [1:12119] "39086092-43-A/T" "39030115-36-G/T" "39036131-46-C/T" "39031387-28-T/A" ...

class(Ho) # numeric

[1] «числовой»

head(Hs)

39086092-43-A/T 39030115-36-G/T 39036131-46-C/T 39031387-28-T/A  39043148-8-C/T 
0.006920332     0.013888210     0.014083799     0.192105517     0.049438143 
 39052543-5-C/T 
0.027391975

PS.Отредактировано сегодня утром после того, как я нашла пост о помощи Markdown.Теперь легче читать, по крайней мере.

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...