Это не «ошибка» с Angular CLI, но файл конфигурации на уровне, которого, вероятно, не должно быть./home/shirley/.angular.json
указано в ошибке, и ошибка предполагает, что вы удалили ее.Если вам не нужен этот файл для чего-то еще, над чем вы работаете, удалите файл.Если вам нужен файл, Angular CLI не будет работать на этом уровне.
ls -a /home/shirley/ <-- file is in here
rm /home/shirley/.angular.json <-- remove it