Эти два построены из исходного кода и прочего git ... но другие клиенты используют libgit2, и это совершенно другая реализация, поэтому нет никаких гарантий для других клиентов.
PS Эти два одинаковы, верно?Я думал о git для windows и git через cygwin .... в любом случае.