Я создал функцию внутри ShipServiceImpl.java для использования в качестве webservice. После этого при переходе к ShipServiceModule.xml> Webservice> SOAP> Service Custom Method созданный выше метод недоступен.Здесь определение функции:
public class ShipServiceImpl extends ApplicationModuleImpl{
public List<ResponseVO> updateLine(String orderNumber,String customer,String qty)
{
return list;
}